Thermo Fisher lanza el ensayo de investigación Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight para la vigilancia del SARS-CoV-2

(Waltham, MA, EUA) lanzó el ensayo de investigación Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight para mejorar la vigilancia del SARS-CoV-2.

El ensayo fue diseñado para permitir la identificación temprana de variantes nuevas y conocidas de muestras que tienen cargas virales más bajas. Al secuenciar más del 99% del genoma del SARS-CoV-2, el ensayo cubre todos los serotipos potenciales. El nuevo ensayo de investigación, Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight, amplía y mejora los esfuerzos de vigilancia locales, regionales y nacionales para descubrir variantes emergentes del SARS-CoV-2 a través de la secuenciación de próxima generación (NGS) altamente sensible. Combinado con la tecnología NGS de Thermo Fisher, el panel permite a los investigadores obtener conocimientos epidemiológicos con un tiempo de respuesta rápido, automatización del flujo de trabajo e informática fluida y carga de datos en repositorios públicos de datos SARS-CoV-2.

Optimizado para ser procesado en el sistema Ion GeneStudio S5, el ensayo incluye 237 amplicones específicos para el SARS-CoV-2, con la adición de cebadores tolerantes a variantes para las variantes emergentes. La mayor sensibilidad de este ensayo permitirá a los investigadores secuenciar el genoma completo y descubrir nuevas variantes a partir de una variedad de tipos de muestras, incluidos hisopos nasofrénicos y nasales poco profundos, saliva y otros, y con valores de umbral de ciclo (Ct) superiores a 28 o tan bajos como 50 copias virales. Para agilizar aún más el análisis NGS del SARS-CoV-2 y ayudar a satisfacer la creciente demanda de los clientes, Thermo Fisher comenzó a optimizar el ensayo de investigación Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight para el sistema Ion Torrent Genexus. Lanzada en noviembre de 2019, la plataforma de secuenciación más nueva de la compañía automatiza todo el flujo de trabajo específico de la NGS y puede entregar muestras para informar económicamente en solo un día. La optimización y validación del ensayo de investigación en el sistema Genexus se realiza en colaboración con los clientes de Thermo Fisher.

“Los virus ARN como el SARS-CoV-2 mutan a altas tasas en respuesta a presiones ambientales selectivas, lo que requiere que los laboratorios y los desarrolladores de vacunas controlen las mutaciones con diligencia”, dijo Andy Felton, vicepresidente de secuenciación clínica de próxima generación en Thermo Fisher. “Se necesitan ensayos de secuenciación de próxima generación de mayor sensibilidad para identificar mutaciones más temprano en individuos sintomáticos y asintomáticos con el fin de ayudar a los funcionarios de salud pública y los laboratorios a rastrear globalmente la propagación de variantes nuevas y conocidas para las decisiones de salud pública y la orientación a nivel local”.

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