Científicos identifican ocho “supervariantes” genéticas que aumentan el riesgo de morir por COVID-19

Se ha descubierto que la gravedad de la COVID-19 es muy heterogénea y algunos pacientes no presentan síntomas mientras que otros quedan discapacitados o mueren. Además, los hombres y algunos grupos étnicos parecen tener un mayor riesgo de muerte por COVID-19, lo que implica que los factores genéticos del huésped pueden influir en el riesgo individual de muerte. Usando una nueva técnica de análisis potencialmente poderosa, los investigadores de Yale descubrieron la razón detrás de la fuerte variación en los resultados de los pacientes con COVID-19 incluso después de recibir un tratamiento idéntico.

Los investigadores primero buscaron variantes asociadas con la mortalidad a través de un GWAS utilizando datos de 1.778 pacientes infectados con SARS-CoV-2. De estos pacientes, el 25,03% (445) finalmente murió. Dado que el primer análisis no identificó variantes significativas, los investigadores de Yale adoptaron el concepto de supervariante para la detección de factores genéticos con el fin de mejorar el poder de la GWAS y tener en cuenta las posibles interacciones multiloci.

En el segundo tipo de análisis, los investigadores observaron más de 18.600.000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), que representaban 146 muertes y 402 sobrevivientes. Mediante métodos de clasificación y agregación locales, identificaron las supervariantes significativas y luego aplicaron la técnica de bosque aleatorio para clasificar los SNP en términos de su importancia. Luego, el equipo pasó a agregar los mejores SNP de cada conjunto en supervariantes. Los investigadores adoptaron este enfoque ya que el desarrollo de COVID-19 está relacionado, tanto con la exposición ambiental como con la genética, aunque la genética podría tener una mayor influencia en la mortalidad. Además, dado que la COVID-19 es un síndrome complejo, los resultados pueden involucrar la interacción de múltiples factores genéticos.

Los investigadores descubrieron ocho “supervariantes” que se identificaron consistentemente en múltiples replicaciones como loci de susceptibilidad a la mortalidad por COVID-19. Según los investigadores, las supervariantes son “una combinación de alelos en múltiples loci análogos a un gen”. A diferencia de un gen, que representa una región específica en un cromosoma, los loci que contribuyen a una supervariante no están restringidos a ninguna ubicación particular en el genoma. Los investigadores descubrieron las supervariantes en los cromosomas 2, 6, 7, 8, 10, 16 y 17. Estos cromosomas contienen variantes y genes relacionados con disfunciones de los cilios (DNAH7 y CLUAP1), enfermedades cardiovasculares (DES y SPEG), enfermedades tromboembólicas (STXBP5), disfunciones mitocondriales (TOMM7) y función del sistema inmunológico innato (WSB1). Los investigadores esperan que estos hallazgos puedan proporcionar evidencia y pistas oportunas para una mejor comprensión de la patogénesis molecular de la COVID-19 y la base genética de la susceptibilidad heterogénea, con un impacto potencial en nuevas opciones terapéuticas.

Enlace relacionado:
Universidad de Yale