Estuche de marcaje permite el análisis por microhileras de ADN tumoral conservado

El método puede ser usado para ADN de muestras tumorales preservadas, anteriormente consideradas demasiado alteradas para ser examinadas.

El método está basado en la tecnología de sistema de unión universal (ULS, por sus siglas en inglés) Kreatech (Amsterdam, Holanda), una tecnología de marcaje directo no enzimática optimizada por oligo microhileras CGH Agilent (Santa Clara, CA, EUA). El método de marcaje enzimático puede introducir alteraciones y reducir además el tamaño del fragmento de ADN. La tecnología nueva de marcaje presenta un protocolo simple, de un solo tubo, reduciendo el costo por experimento.

Hay aproximadamente 400 millones de muestras preservadas FFPE en los bancos de tejidos en el mundo, y el ADN en esas muestras ha sido considerado demasiado degradado para usar en técnicas de análisis de microhileras como aCGH, que es un método poderoso para estudiar la variación del número de copias de ADN en cánceres y enfermedades genéticas. Por ejemplo, el departamento de patología y medicina de laboratorio de la Universidad de Pennsilvania (Filadelfia, EUA) tiene aproximadamente 600.000 muestras de tejido en parafina que datan de los años 40. La capacidad nueva de marcaje permitiría un análisis retrospectivo más integral de biobancos de muestras y depósitos clínicos en un número grande de centros de cáncer.

"Nuestra comparación de datos mostró que el nuevo estuche de marcaje no enzimático Agilent es superior al protocolo de marcaje de ADN estándar basado en Klenow”, dijo Lynda Chin, M.D., del Instituto de Cáncer Dana-Farber (Boston, MA, EUA). "La señal mejorada conseguida con esta técnica de marcaje no enzimático fue más aparente cuando se trabaja con ADN genómico modestamente degradado extraído de muestras en parafina fijadas con formalina”,




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