Análisis de la variación de genes de bacterias intestinales revela estabilidad notable

Investigadores de la Escuela de Medicina de la Universidad de Washington (St. Louis, MO, EUA) y el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (Heidelberg, Alemania) desarrollaron un marco para el análisis de la variación metagenómica y lo aplicaron a 252 metagenomas fecales de 207 individuos de Europa y Norteamérica.

Los investigadores reportaron en la edición digital, del 5 de Diciembre de 2012, de la revista Nature que usando 7,4 billones de lecturas alineadas a 101 especies de referencia, detectaron 10,3 millones de polimorfismos nucleótidos simples (SNP), 107.991 inserciones/deleciones y 1.051 variantes estructurales. Las personas muestreadas a intervalos variables de tiempo mostraron individualidad y estabilidad temporal de los patrones de variación SNP, a pesar de los cambios considerables de composición en la población de microorganismos en sus tractos digestivos.

El hallazgo de que cada individuo tiene un genotipo metagenómico único puede ser explorado en el futuro para el desarrollo de dietas o regímenes de medicamentos personalizados.

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Universidad de Washington

Laboratorio Europeo de Biología Molecular