Secuenciación del exoma total ilustra daño del ADN en el carcinoma seroso uterino

La secuenciación del exoma es una estrategia eficaz para secuenciar selectivamente las regiones codificantes del genoma y, como tal, es una alternativa más barata pero eficaz para la secuenciación de todo el genoma. Los exones son secuencias cortas, funcionalmente importantes del ADN, que representan las regiones de los genes que se traducen en proteínas y la región no traducida (UTR) que las flanquea. Las UTR no suelen incluirse en los estudios del exoma. En el genoma humano, existen alrededor de 180.000 exones, los cuales constituyen aproximadamente el 1% del genoma humano. Se estima que las regiones codificantes de proteínas del genoma humano constituyen aproximadamente el 85% de las mutaciones causantes de enfermedades.

Los resultados, publicados en la edición digital del 28 de enero de 2013, de la revista Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), revelaron que 52 tumores de USC tenían menos de 100 (mediana en 36) mutaciones somáticas, mientras que cinco tenían más de 3.000. Las mutaciones en estos últimos tumores mostraron características distintivas de defectos producidos por desajustes en la reparación del ADN. Entre el resto, había un significativo aumento del número de mutaciones en 14 genes. Además de los oncogenes bien conocidos (es decir, TP53, PIK3CA, PPP2R1A, KRAS, FBXW7), hubo mutaciones frecuentes en CHD4/Mi2b, un componente del complejo de remodelación de la cromatina NuRD y en TAF1, un componente del mecanismo principal de transcripción del TFIID. Además, se encontró que la variación en el número de copias somáticas desempeña un papel importante en el USC, con una ganancia de 13 y una pérdida de 12, en el número de copias, producidas con más frecuencia de lo que cabría esperar de un resultado al azar.

Estos hallazgos permiten detectar mutaciones frecuentes debidas a daños en el ADN que afectan la remodelación de la cromatina así como el ciclo celular y las vías de la proliferación celular del USC y sugieren posibles objetivos para el tratamiento de esta variante letal del cáncer de endometrio.

“Hemos identificado claramente las mutaciones que son responsables de los tumores del USC”, dijo el autor principal, el Dr. Alessandro Santin, profesor de obstetricia, ginecología y ciencias de la reproducción, de la Universidad de Yale. “Además de una serie de oncogenes bien conocidos, hemos encontrado tres genes que no habían sido previamente asociados con el cáncer y que se encuentran en estos tumores. Este hallazgo señala nuevas vías que podrían ser importantes en el desarrollo de tratamientos, más adelante”.

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Yale University